Segmentação automática da aorta

Curso de OsiriX e Horos · Segmentação

Nesta aula eu mostro como fazer segmentação automática da aorta (e outras estruturas) no OsiriX, para transformar um dataset “poluído” em uma imagem limpa, pronta para reconstruções 3D (Volume Rendering) bem bonitas. A lógica do método é: Selecionar um ponto com bom contraste e criar um ROI que cresce em 3D (para cima e para baixo na série) Editar o ROI (fechar orifícios e dilatar) para melhorar a seleção Transformar tudo fora do ROI em densidade negativa (como ar), facilitando o 3D Gerar o 3D Volume Rendering e finalizar removendo o que sobrou (tesoura + Delete) 1) Criar a segmentação 3D da aorta (Grow Region) Ajusto um janelamento vascular Dou zoom em um ponto onde a aorta está bem opacificada Vou em ROI → Grow Region 2D/3D Segmentation Escolho 3D Grow Region Ajuste do intervalo (HU) O OsiriX seleciona um intervalo em HU acima/abaixo do ponto clicado Eu testo valores menores e maiores para entender o efeito No exemplo, 150 funciona bem para selecionar a aorta e ramos com densidade um pouco menor Depois eu mando computar a seleção e verifico navegando para cima/baixo que foram incluídos: tronco celíaco mesentérica superior renais 2) Refinar o ROI: fechar buracos e dilatar Como aparecem orifícios dentro da seleção: ROI → Brush → Closing Fecho orifícios com tamanho ≤ 4 voxels Para não ficar só no lúmen: ROI → Brush → Dilatation Dilato 2 voxels para incluir um pouco além do contraste (adventícia) 3) Pintar tudo fora do ROI com densidade negativa ROI → Set Pixel Value Seleciono Outside ROIs Aplico valor negativo (no vídeo: -2048, poderia ser -1024) Assim, tudo que está fora da aorta vira “ar”, o que deixa o 3D muito mais simples de montar. (No exemplo é um exame grande, com ~2600 imagens, então o cálculo pode demorar.) 4) Gerar o 3D e lidar com exame grande (Clip vs Resample) Vou em 3D Volume Rendering Como o dataset é grande, aparece um comportamento relacionado ao dynamic range Mostro que dá para: Resample (comprimir a variação) ou Clip (cortar extremos) — escolho Clip por ser mais rápido Resultado: uma aorta segmentada com ramos bem visíveis e uma imagem 3D “limpa” para trabalhar. 5) Finalização rápida: tesoura + Delete Se ainda sobrar: vértebras/bacia coração (pode pegar contraste junto) Eu finalizo com: tesoura no 3D seleciono e aperto Delete É um pós-processamento rápido e o resultado fica bem impressionante.