Segmentação da aorta v2

Curso de OsiriX e Horos · Segmentação

Nesta aula eu demonstro um fluxo automático de segmentação da aorta (e estruturas vasculares) no OsiriX, para transformar um dataset “poluído” (com ossos, órgãos e outras estruturas) em uma imagem limpa, ideal para reconstruções 3D (Volume Rendering) bem bonitas. A ideia é: selecionar a aorta com contraste, expandir essa seleção em 3D, corrigir o ROI (fechar orifícios e dilatar) e depois pintar tudo fora do ROI com densidade negativa (como ar). Com isso, o 3D fica muito mais fácil de gerar e de “lapidar”. Visão geral do método Selecionar a aorta com contraste usando um ROI 2D Expandir para 3D (para cima e para baixo na série) com Grow Region 3D Editar o ROI: Closing para fechar orifícios Dilatation para incluir um pouco além do lúmen (adventícia) Set Pixel Value (Outside ROI) para colocar densidade negativa fora da seleção Gerar 3D Volume Rendering e finalizar com cortes rápidos (tesoura + Delete) Passo a passo (como no vídeo) 1) Preparar a visualização Estou na imagem axial Ajusto um janelamento vascular (brilho/contraste) para facilitar a seleção 2) Criar a segmentação automática com ROI Dou zoom em uma região onde a aorta tem boa densidade (bem opacificada) Vou em ROI → Grow Region 2D/3D Segmentation Escolho 3D Grow Region (não o 2D) Ajuste do intervalo (HU) O OsiriX seleciona baseado em um intervalo (ex.: X unidades de HU acima e abaixo do ponto clicado) Eu demonstro testando valores menores (ex.: 30) e maiores No exemplo, 150 funcionou bem para pegar também ramos com densidade um pouco menor Depois, eu mando o OsiriX computar a seleção 3D e consigo navegar para cima/baixo verificando: tronco celíaco mesentérica superior renais selecionados junto com a aorta. 3) Corrigir falhas do ROI (orifícios) e refinar a seleção Como surgem “buracos” dentro da seleção: Vou em ROI → Brush → Closing Fecho orifícios com tamanho ≤ 4 voxels Depois, para não ficar só no lúmen: Vou em ROI → Brush → Dilatation Dilato 2 voxels (no exemplo) para “engordar” um pouco a seleção 4) Pintar tudo fora do ROI com densidade negativa Agora vem o pulo do gato para “limpar” o dataset: Em ROI → Set Pixel Value Escolho: Outside ROIs Um valor negativo (ex.: -2048; poderia ser -1024 também) Assim, tudo que está fora do ROI vira “ar” (densidade negativa), facilitando o 3D No vídeo eu comento que o exame é grande (cerca de 2600 imagens), então esse cálculo pode demorar um pouco. 5) Gerar o 3D e resolver o “dynamic range” (exame grande) Após o processamento, eu removo/oculto o ROI para visualizar o resultado “limpo” Vou em 3D Volume Rendering Como o exame é muito grande, aparece uma situação em que o escopo/dynamic range fica exagerado Eu mostro duas opções: Resample (comprime a variação) Clip (corta extremos) — escolho Clip por ser mais rápido para o computador Resultado: uma aorta segmentada com ramos bem visíveis e um 3D bem mais “trabalhável”. Finalização rápida (pós-processamento) Mesmo com segmentação automática, podem sobrar: um pouco de coração (por contraste) vértebras / bacia Aí eu uso: Tesoura no 3D seleciono e aperto Delete Fazendo cortes por ângulos diferentes, dá para “esculpir” rápido e chegar num resultado bem limpo.