Curso de OsiriX e Horos
por Dr. Alexandre Amato & Dr. Daniel Benitti
O curso completo de OsiriX e Horos, criado pelo Dr. Alexandre Amato e pelo Dr. Daniel Benitti, cirurgiões vasculares certificados pela OsiriX Foundation, espelhado aqui a partir do canal gratuito no YouTube. São 42 aulas curtas e práticas, do básico ao avançado: introdução ao Mac para quem vem do Windows, navegação e configuração do OsiriX, banco de dados e Smart Albums, reconstruções 3D (Volume e Surface Rendering, fly-through e impressão 3D), MPR curvo e centerline, medidas vasculares precisas, segmentação automática da aorta e da via aérea, planejamento de EVAR e do arco em C, estenose de carótida e angiografia cerebral, laudos, imagens-chave e montagem de uma rede PACS. Software gratuito (OsiriX Lite e Horos) e conteúdo aberto: assista quando quiser, sem custo e sem cadastro.
42 aulas6h 32minIntermediárioGratuitoProfissionais da Saude
Conteúdo do curso
1. Introdução e Básico
OsiriX do zero: navegação e ferramentasNesta aula fazemos uma introdução ao OsiriX, passando pela interface e pelas ferramentas básicas mais usadas no dia a dia e no planejamento endovascular.
Você vai ver:
O que é o OsiriX e como ele trabalha com exames DICOM
Diferenças entre versões (32-bits gratuita, 64-bits paga e OsiriX MD)
Como navegar na tela inicial (álbuns, lista de exames, miniaturas e banco de dados)
Como abrir e comparar datasets (ex.: fase arterial e venosa) e usar a sincronização
Ajuste de janelamento (HU) com brilho/contraste e por que "bone" ajuda no vascular
Por que medir só no axial pode errar e como usar 3D MPR para cortes perpendiculares ao vaso
Uso do MIP para medir extensão (e por que não usar para diâmetro)
Noções de organização (Albums/Smart Albums) e personalização da toolbar44min
Introdução ao Mac para médicosNesta aula fazemos uma introdução ao Mac (macOS) voltada para quem vai usar o computador na prática médica, especialmente com o OsiriX e análise de imagens médicas DICOM. Se você está migrando do Windows para o Mac, aqui estão as dicas que evitam as confusões mais comuns e aceleram muito o trabalho.
1) Windows, Linux e Mac: visão rápida
Windows: mais popular; precisa rodar em milhares de hardwares diferentes (drivers), o que pode aumentar incompatibilidades.
Linux: muito usado em servidores e “aparelhos” (ex.: roteadores); há soluções PACS dedicadas (ex.: Conquest / dcm4chee).
Mac: hardware e software feitos pela mesma empresa → integração melhor e, em geral, menos travamentos no uso de aplicativos de imagem.
Também comento que existem muitos visualizadores DICOM (não só OsiriX), e cito o site idoimaging.com como lista de viewers por sistema.
2) Teclado do Mac: equivalências e atalhos importantes
Ctrl (Windows) ↔ Command (Mac)
Alt (Windows) ↔ Option (Mac)
No Mac, a tecla Delete funciona como Backspace do Windows
Para “Delete” como no Windows: Function + Delete
No OsiriX, essas teclas aceleram muito:
Shift + mouse: zoom
Option + mouse: brilho/contraste
Command + mouse: mover imagem
Ctrl: informações extras
3) Acentos “igual Windows” no Mac
O método padrão do Mac usa combinações com Option (ex.: Option+E, Option+C etc.).
Se você quer digitação como no Windows:
Vá em Preferências do Sistema → Idioma e Texto / Teclado → Input Sources
Selecione US International PC
(É essa opção que deixa os acentos no padrão que a maioria está acostumada no Windows.)
4) Prints para documentar medidas/planejamento
Command + Shift + 3: captura a tela inteira
Command + Shift + 4: captura uma área selecionada
Command + Shift + 4 + barra de espaço: captura uma janela
Útil para salvar imagens com medidas do OsiriX e imprimir ou compartilhar.
5) Fechar apps no Mac (erro clássico de quem vem do Windows)
Clicar no X vermelho fecha só a janela; o programa pode continuar aberto.
Para fechar de verdade:
Command + Q (Quit)
Muitos apps abertos podem deixar o Mac lento por consumo de memória.
6) Finder, organização e preview rápido
Finder = “Explorer” do Windows
Barra de espaço abre um preview rápido do arquivo (imagem, PDF, vídeo etc.) sem abrir o app
Etiquetas coloridas ajudam a organizar (e dá para nomear nas preferências)
Command + I mostra informações do arquivo (tamanho, detalhes)
7) Spotlight: uma das ferramentas mais úteis
Acessos:
Lupa no canto superior direito ou Command + barra de espaço
Ele serve para:
abrir programas rapidamente (ex.: digitar “OsiriX”)
fazer cálculos (ex.: oversize 20% → 4*1.2)
encontrar arquivos pelo nome ou pelo conteúdo (inclusive e-mails, contatos etc.)
8) Como instalar o OsiriX
Duas formas citadas:
Site: osirix-viewer.com → Downloads → baixar e instalar
App Store: atualiza automaticamente, porém não permite plugins (restrição legal)
No instalador, basta seguir o pacote e concluir a instalação.
9) Compartilhar tela / comunicação
Opções comentadas:
Messages/iChat: compartilhamento de tela e webcam (videoconferência)
Skype: compartilhamento de tela (sem controle remoto)
TeamViewer, LogMeIn, CrossLoop, YouGoo: alternativas para compartilhar e/ou controlar remotamente (algumas pagas, algumas com uso gratuito)27min
Configurações essenciais do OsiriXNeste vídeo eu dou dicas práticas de configuração do OsiriX pelas Preferências, focando no que realmente ajuda no dia a dia. Eu passo pelos menus General (Básico) e Database (Banco de dados), mostrando o que vale a pena ajustar, o que é melhor manter padrão e quais opções evitam dor de cabeça (principalmente com importação e organização de exames).
1) Acessando as Preferências
Caminho: OsiriX → Preferences
Você vai ver grupos como Basic, Display e Sharing. Aqui eu foco no Basic e depois em Database.
2) Basic → General (Geral): o que eu recomendo
Cadeado (admin lock): serve para travar as preferências e impedir que outras pessoas alterem configurações (útil em computador compartilhado).
Sincronizar preferências: é avançado; útil se você tem vários OsiriX em vários computadores e quer manter tudo padronizado por um administrador.
Display notifications: controla as notificações que aparecem na tela.
Sistema DICOM: manter em DCMTK (não há motivo prático para trocar).
JPEG em DICOM: lembrar que JPEG é compressão com perda. É importante conseguir abrir exames assim, mas:
Nunca recomprimir arquivos que já vieram comprimidos (para não degradar mais a qualidade).
Atualização de plugins e versões: pode deixar ligado, mas, dependendo do fluxo de trabalho, as mensagens frequentes de atualização podem incomodar.
Permitir edição de metadados DICOM: eu sugiro deixar desligado, porque normalmente não há motivo para editar dados do paciente/exame.
Idiomas: escolha os idiomas que o OsiriX vai permitir.
3) Database: configurações que impactam seu dia a dia
Local do banco de dados
Normalmente fica no padrão (Documents Database).
Só mude se você quiser manter o banco em outro disco (por exemplo, externo).
Importar apenas DICOM
A opção “Import DICOM File Format Only”: eu gosto de deixar desligada para poder importar JPEG/TIF e outras imagens quando necessário.
Validar arquivos
Pode ser útil para checar se os arquivos estão bem formados como DICOM.
Copiar vs. linkar arquivos importados (ponto crítico)
“Copiar arquivos para o banco de dados sempre” ou “sempre perguntar”:
Minha recomendação: escolha um padrão e não fique mudando, porque misturar “copiar” e “linkar” pode fazer você perder a origem e quebrar o link → depois o exame pode não abrir.
4) Formato e exibição de dados
Formato de data/hora: ajustar para o padrão brasileiro.
Fonte e idade: mostrar idade atual e/ou idade na data do exame (no vídeo, eu deixo as duas).
5) Database Autocleaner (limpeza automática)
Serve para economizar espaço, especialmente em laptops:
Apagar exames seguindo critérios (por exemplo, quando o espaço em disco estiver baixo).
Opções relacionadas a apagar originais/linkados (atenção aqui: é justamente para controlar armazenamento).
6) Reports (laudos)
Você pode escolher qual editor abrirá os laudos: Pages, Word, TextEdit, LibreOffice etc.
7) CD/DVD: quando inserir um disco
Configurações úteis:
Copiar todo o conteúdo para o banco de dados
Ejetar o disco quando terminar a cópia
Procurar DICOM: em vez de depender só do “DICOMDIR”, pode ser útil mandar o OsiriX procurar arquivos no disco, porque muitos laboratórios no Brasil gravam o CD fora do padrão.
Gravar CD
Evitar “preferir JPEG”, porque perde qualidade.
Dá para incluir uma pasta extra (ex.: material do consultório), se fizer sentido.
8) Protocols e Hotkeys
Protocols: não entro em detalhes aqui.
Hotkeys: mostra atalhos úteis para acelerar o uso.8min
Personalizar barra de ferramentasNesta aula eu mostro como configurar e personalizar a barra de ferramentas (Toolbar) do OsiriX, tanto na janela do Banco de Dados quanto na janela de Visualização (Viewer). A ideia é deixar na tela apenas o que você realmente usa, economizando espaço (principalmente em laptops) e deixando o fluxo de trabalho mais rápido.
1) Toolbar na janela do Banco de Dados (Database)
Cada janela do OsiriX tem sua própria barra de ferramentas (os ícones no topo).
Clicando com o botão direito em uma área vazia da barra, você pode:
Mostrar só ícones
Mostrar só texto
Mostrar ícone + texto (geralmente o mais confortável em telas grandes)
Usar ícones pequenos
Esconder a barra de ferramentas
Dica do vídeo: em telas pequenas (MacBook Air / notebooks), pode valer a pena usar só ícone ou só texto para ganhar espaço.
Customize Toolbar (personalização)
Ainda clicando com o botão direito em área vazia, escolha Customize Toolbar.
Abre uma janela onde você pode arrastar ferramentas para dentro/fora da barra.
Tudo o que aparece ali também pode ser acessado pelos menus, então você pode remover itens que não usa com frequência.
Sugestões do vídeo: o que pode remover no Database
Query e Sender (para quem não usa OsiriX em rede)
Burn (em Macs novos sem gravador de CD)
Anonymize (se você não exporta exames anonimizados)
Movie Export (se você não exporta vídeos)
E-mail (evita o envio com ZIP + senha, que costuma ser bloqueado por provedores como Gmail)
Metadata (para quem não mexe nos metadados do exame)
4D Viewer (só para quem trabalha com “quarta dimensão”/tempo)
Report (só para quem faz laudos)
Se quiser colocar algo de volta, é só arrastar novamente para a barra.
Para voltar ao padrão: arraste o conjunto de itens “default” (barra inteira mostrada na janela de personalização) e solte na Toolbar.
2) Toolbar na janela de Visualização (Viewer)
Ao abrir um exame, a janela do Viewer tem outra Toolbar, com ferramentas diferentes.
As opções são as mesmas:
Só ícone / só texto / ícone + texto
Esconder
Ícones pequenos
Customize Toolbar para arrastar e soltar itens
Observação do vídeo: em laptops, algumas ferramentas podem “sumir” para o canto por falta de espaço, então ajustar a Toolbar ajuda bastante.
Itens citados como importantes no Viewer (exemplos do vídeo)
Acesso ao banco de dados
Ferramentas principais de visualização
Reconstruções (ícone da engrenagem) — muito importante
Filtros 2D
Sincronização
WL/WW (Window Level/Window Width) para janelamento (Hounsfield, abdome, vias aéreas etc.)
Plugins e ferramentas especializadas
Na lista do Customize Toolbar aparecem também plugins e cálculos:
Ex.: fração de ejeção (cardiologia)
Ex.: cálculo de volume (plugin)
Ex.: 4D
Ex.: impressão (se você usa o OsiriX para imprimir com frequência)
Ex.: ângulo de Cobb (ortopedia)
Dica final do vídeo: vale sempre olhar essa lista, porque ela muda conforme a versão do OsiriX, com novidades e plugins novos.8min
OsiriX sem propaganda (LXIV)Neste vídeo eu dou uma dica que, na prática, resolve uma das maiores reclamações da versão gratuita do OsiriX: propagandas da versão paga e limitações (32-bits), incluindo mensagens e restrições para abrir exames grandes.
O OsiriX é open source, então o código-fonte fica disponível e outras pessoas podem compilar e criar versões paralelas (forks). A empresa do OsiriX libera gratuitamente apenas a versão 32-bits, com limitações. Para usar 64-bits, em geral você precisaria comprar a versão paga ou compilar por conta própria (o que não é simples).
A dica: um fork 64-bits “sem as chateações”
Eu mostro um fork compilado por Alex Bettarini, chamado no vídeo de OsiriX “LXIV” (baseado na versão 5.9 do OsiriX). A ideia é ter um OsiriX 64-bits, sem as propagandas e sem aquelas limitações da versão 32-bits.
No vídeo eu passo pelo fluxo completo:
1) Onde baixar
No site indicado no vídeo (seção Downloads)
Arquivo com cerca de 42 MB, baseado no OsiriX 5.9 (com a observação de que a 6.0 existe, mas pode ter perdido algumas funcionalidades neste contexto)
2) Evitar sobrescrever seu OsiriX atual
Após baixar, eu arrasto o app para o Desktop
Como o app vem com o nome “OsiriX”, eu renomeio (ex.: LXIV)
Assim dá para manter dois OsiriX no mesmo Mac sem conflito.
3) Liberar no macOS (Segurança e Privacidade)
Por não ser “desenvolvedor identificado”, o macOS bloqueia
Eu entro em Preferências do Sistema → Segurança e Privacidade e escolho “Abrir mesmo assim”
Digito a senha e o app abre normalmente
4) Teste prático
O OsiriX novo já encontra o mesmo banco de dados do OsiriX original
Eu abro um exame grande e mostro que ele abre sem a limitação de quantidade de imagens que aparece na versão 32-bits6min
OsiriX Gratuito vs PagoNesta aula eu mostro, na prática, a diferença entre o OsiriX Gratuito e o OsiriX Pago, focando no que mais causa confusão no dia a dia: a limitação do OsiriX 32-bits para abrir exames com muitas imagens (datasets grandes) e como isso muda na versão 64-bits.
1) Como identificar o OsiriX gratuito (Free)
No OsiriX gratuito:
aparece uma propaganda do OsiriX MD (na parte de baixo).
ao abrir About, eu vejo que é uma versão 32-bits.
ao entrar em um exame, aparece um aviso sugerindo que não é para uso médico.
O principal problema do Free aparece quando você tenta abrir um exame muito grande (ex.: milhares de cortes).
2) A grande diferença: abrir exames com muitas imagens
No exemplo do vídeo, ao tentar abrir um exame grande (ex.: ~2.800 imagens), o OsiriX gratuito avisa que a versão 32-bits não consegue abrir o dataset completo.
O que o OsiriX Free permite fazer como "contorno":
Opção A) Abrir em partes (duas imagens do mesmo dataset)
Ele sugere abrir o estudo "separado", para contornar a limitação — mas você não fica com o dataset completo de uma vez.
Opção B) Limitar o intervalo de cortes que será aberto
Para chegar na janela de limitação:
pressione Option e clique em 2D Viewer
Aí você pode:
escolher o corte axial mais alto e o mais baixo (abrir só um trecho)
reduzir até chegar em um número que o Free consiga abrir (no vídeo, até ~1.400 cortes já aparece alerta)
Opção C) Aumentar o "intervalo"
intervalo 2 = abre uma imagem sim, uma não
isso permite abrir o exame inteiro, mas pulando cortes (menor resolução de navegação)
Essas são formas de "passar" a limitação do 32-bits sem travar o fluxo de trabalho.
3) OsiriX pago (64-bits): o que muda
Na versão paga:
em About, aparece 64-bits
ao abrir o exame, o aviso que aparece é que a versão não foi certificada para decisão médica (você clica em I Agree)
o principal ganho é que ela consegue abrir datasets grandes completos, sem precisar reduzir o número de imagens
No vídeo, eu mostro um computador com 16 GB de RAM conseguindo abrir o estudo inteiro.
Observação importante do vídeo: se o computador tiver pouca memória RAM, a vantagem do 64-bits pode ser menor — porque abrir datasets grandes depende também de memória disponível.
4) Mesmo no 64-bits, você ainda pode limitar para ganhar desempenho
Mesmo na versão paga, ainda dá para:
pressionar Option e clicar em 2D Viewer
limitar o intervalo de cortes para o OsiriX trabalhar mais rápido
Só que, diferente do Free, não é obrigatório para conseguir abrir o exame.5min
2. Banco de Dados
Como criar novo banco de dadosNeste vídeo eu mostro como criar outro banco de dados no OsiriX (Database Folder). Isso é muito útil para:
Backup em HD externo
Guardar exames quando o disco do notebook tem pouco espaço
Criar um banco separado para exames antigos sem “pesar” o banco principal
No exemplo, eu já tenho o banco padrão (Documents Database) e crio um segundo banco em um drive externo.
1) Criar um novo banco de dados (Database Folder)
No OsiriX:
Vá em File → New Database Folder
Escolha o disco externo (ou outro local)
Crie a pasta (pode nomear como quiser)
Confirme em Create
A partir disso, você passa a ter duas pastas de banco de dados disponíveis no OsiriX.
2) Mover exames entre bancos (arrastar e soltar)
Com os dois bancos criados:
Você pode arrastar um paciente/exame do banco principal para o banco novo
No vídeo eu passo dois exames para o banco do drive externo
Ao abrir o banco novo, os exames já aparecem lá.
3) O que é essa pasta “OsiriX Data” (e o que NÃO fazer)
O OsiriX cria dentro do local escolhido a estrutura chamada OsiriX Data, com a árvore necessária para o banco funcionar.
Importante:
Apesar de conter arquivos DICOM, isso não é uma “pasta comum de DICOM”, é um banco de dados
Não recomendo mexer manualmente nos arquivos dentro dessa pasta, para evitar bagunçar a estrutura e perder estudos
4) Posso colocar o banco no Dropbox?
Teoricamente funciona, mas com riscos:
Se você mantiver tudo sincronizado e nunca abrir o OsiriX em dois computadores ao mesmo tempo usando esse mesmo banco, pode funcionar.
Se abrir em dois Macs simultaneamente, o OsiriX altera o banco em tempo real e um não “entende” a alteração do outro, o que pode corromper o banco e causar perda de dados.
Por isso, não recomendo essa solução como rotina.
5) Como abrir esse banco em outro computador
Se você criou um banco em um HD externo e quer usar em outro Mac:
Conecte o drive
Vá em File → Open Database Folder
Selecione a pasta OsiriX Data desse banco
Clique em Open
Isso cria o “link” para aquele banco nesse outro computador.
Funciona muito bem para compartilhar um banco portátil entre vários computadores, desde que não seja ao mesmo tempo.
6) Dica essencial: manter a mesma versão do OsiriX
Se você usa o mesmo banco em computadores diferentes:
Mantenha todos os OsiriX na mesma versão
Um OsiriX mais novo pode alterar o banco de um jeito que o outro (mais antigo) não acompanha, podendo causar perda de informação/exames.5min
Remover banco de dadosNeste vídeo eu mostro uma dica bem rápida: como remover um banco de dados (criado em HD externo, por exemplo) da lista de Sources/Fonte de imagens no OsiriX.
Muita gente tenta:
Botão direito → não aparece opção
Tecla Delete / Fn+Delete → não funciona
O jeito certo é pelas preferências:
Como apagar o banco das Sources
Abra Preferences
Vá em Database
Entre em Locations
Localize o banco (ex.: Untitled, que é o banco externo criado)
Selecione e pressione Delete (aparece a dica “Press delete to remove”)
Pronto: o banco desaparece das Sources e o problema fica resolvido.1min
Separar exames juntados (Merge)Neste vídeo eu respondo uma dúvida comum: às vezes dois estudos/datasets acabam ficando mesclados no OsiriX (por exemplo, um laudo em texto + uma imagem, ou dois exames diferentes que “viram um só”). Isso pode acontecer ao selecionar dois itens (geralmente com Shift) e usar Merge (juntar).
Para desfazer essa junção e separar novamente, a solução mais simples é:
Clique com o botão direito no exame/paciente (onde ficou tudo junto)
Selecione Reindex Files
O OsiriX recria o índice e volta a separar os arquivos/datasets corretamente
No exemplo, após o Reindex Files, os itens que estavam juntos voltam a aparecer separados, resolvendo o problema.2min
Smart Album avançado (SQL)Nesta aula eu mostro como criar um Smart Album no OsiriX usando critérios avançados (SQL). Além dos filtros simples, o critério SQL permite criar uma condição: se a função for verdadeira, o paciente/exame aparece automaticamente no Smart Album.
1) Como criar o Smart Album
Na janela do Database
Em Albums, clique com o botão direito
Selecione Create Smart Album
2) Por que usar critério avançado (SQL)
Um uso muito prático é separar pacientes por idade.
Para isso, precisamos acessar campos dos metadados do exame (dados sobre os dados). No vídeo, eu mostro dois DataSheets com todos os campos disponíveis e localizo o Date of Birth (data de nascimento), que será o nosso critério.
3) Exemplo do vídeo: Smart Album “Idade”
Nomeio o Smart Album como “idade”
Defino um critério usando Date of Birth
Exemplo aplicado: Date of Birth > 01/01/1980
O OsiriX cria o Smart Album e retorna os pacientes filtrados (no exemplo, encontrou 5 pacientes)
4) Editando o Smart Album
Para editar, basta clicar duas vezes no Smart Album
Ajusto a data para ampliar o filtro:
01/01/1960 (aumenta o número de pacientes)
Também mostro outro exemplo com data acima de 19504min
Smart Album com SQLNesta aula eu explico como criar um Smart Album no OsiriX usando critérios avançados (SQL) — um recurso muito útil quando os filtros simples não resolvem. O exemplo prático do vídeo é organizar o banco de dados separando pacientes por idade, usando a data de nascimento (Date of Birth) presente nos metadados do exame.
Como criar um Smart Album (passo a passo)
Vá na janela do banco de dados
Em Albums, clique com o botão direito
Selecione Create Smart Album
Critérios simples vs. critérios avançados
Os Smart Albums podem ser criados com critérios simples (as opções padrão da janela).
Para filtros mais úteis (como idade), usamos um critério avançado, baseado em SQL.
A lógica é: criar uma função/condição e, se ela for verdadeira, o exame/paciente aparece no Smart Album.
Onde encontrar os campos para usar no critério
No vídeo eu mostro dois DataSheets com as informações disponíveis (metadados do exame).
Neles, é possível localizar o campo Date of Birth (data de nascimento), que pode ser usado como critério.
Exemplo do vídeo: Smart Album por idade (via Date of Birth)
Eu crio um Smart Album chamado “idade”
Defino o critério para filtrar pacientes cuja data de nascimento seja maior que uma data escolhida (exemplo: 01/01/1980)
O OsiriX cria o Smart Album e retorna os pacientes que se encaixam no filtro (no exemplo, foram 5 pacientes)
Editando e refinando o Smart Album
Para editar: clique duas vezes no Smart Album
Troco a data para ampliar o filtro:
Exemplo: ajustar para 01/01/1960 (aumenta o número de pacientes)
E também crio/uso outro exemplo com data acima de 1950
Se ficar alguma dúvida, estou à disposição.4min
Consertar tomografia com fasesEu sou o Dr. Alexandre Amato e nesta aula eu mostro um problema bem comum quando recebemos exames de laboratórios que não gravam no formato padrão: um estudo que parece normal no axial, mas no 3D MPR gera alerta de cortes irregulares e distorção — porque o laboratório colocou dois datasets “um em cima do outro” dentro da mesma série.
No exemplo, ao percorrer o exame da aorta, ele parece normal. Porém, ao abrir no 3D MPR, aparece o aviso de que os cortes estão irregulares, variando de ~1 mm até quase 500 mm, o que pode causar erro de medida e distorções. A causa fica clara: há uma fase arterial (mais contrastada) e, logo abaixo, outra fase menos contrastada (provável venosa/tardia) empilhadas no mesmo dataset.
Como corrigir (passo a passo mostrado no vídeo)
1) Saia do 3D MPR e volte ao dataset axial
Feche a janela do 3D MPR e volte para a série axial do exame (no exemplo, “Angio Aorta”).
2) Faça um backup antes de mexer
Antes de deletar qualquer coisa:
Exporto o exame para o Desktop (DICOM), para não correr o risco de perder o estudo original.
A ideia é editar os arquivos com segurança, mantendo uma cópia intacta.
3) Encontre a “linha de corte” entre as fases
No preview das imagens axiais, eu procuro a última imagem que ainda tem contraste (fase arterial).
No vídeo, dá para perceber o ponto de virada porque:
ainda aparece contraste até certo corte
de repente surgem imagens mais inferiores (ex.: quadril/fêmur)
e a próxima imagem “volta” para uma região superior (ex.: pulmão)
Isso indica claramente que a série “reiniciou” e contém dois blocos (dois datasets).
4) Delete a parte que você quer descartar
Seleciono todas as imagens do ponto de corte para baixo (o bloco duplicado/indesejado).
Aperto Delete e confirmo a exclusão.
No exemplo:
o dataset tinha 700 e tantas imagens
após a limpeza, ficou com 398 imagens
5) Reabra no 3D MPR e confira o alerta
Ao reconstruir novamente, a irregularidade cai bastante (no vídeo, passa a variar de 1 mm para 2 mm).
Resultado: agora você tem um dataset único, adequado para avaliar o paciente sem as distorções causadas pela duplicação.
6) Como recuperar o exame original (se precisar)
Eu reimporto o backup que exportei para o Desktop.
Assim, o OsiriX volta a ter todas as imagens originais, mantendo sua cópia intacta.
No vídeo, eu ainda comento que existe outra possibilidade (como mudar o nome do exame), mas o foco principal é o método simples e seguro: backup → localizar corte → deletar bloco duplicado → reconstruir → reimportar se necessário.7min
3. Reconstrução 3D
Reconstrução 3D: Volume RenderingNeste vídeo eu faço uma introdução às reconstruções tridimensionais no OsiriX, com foco no 3D Volume Rendering. É um tema grande (vamos aprofundar depois), mas aqui eu mostro o básico para você começar a usar 3D no dia a dia: Crop para acelerar, Presets, ajuste de brilho/contraste e como remover ossos do volume.
1) Tipos de reconstrução 3D no OsiriX
Na roda dentada, existem várias reconstruções tridimensionais, como:
3D MIP (Maximum Intensity Projection)
3D Volume Rendering (tema do vídeo)
3D Surface Rendering
Endoscopia 3D
No Volume Rendering, o OsiriX usa os voxels (pontinhos tridimensionais) com densidade para gerar a imagem e aplicar cores/transparências conforme uma escala.
2) Abrindo o 3D Volume Rendering
Entro em 3D Volume Rendering
Para ficar mais rápido, escolho Clip (no vídeo)
3) Crop: a primeira coisa para ganhar desempenho
Muitas vezes o exame inteiro está “grande demais” para o que você precisa.
Eu uso Crop para criar uma “caixa” em volta do volume e reduzir a área de interesse:
Diminuo o cubo (bolinhas verdes) até ficar só o que interessa
Resultado: menos memória, placa de vídeo mais rápida e navegação mais fluida
Depois eu tiro o Crop e sigo com a imagem 3D final
4) Presets e ajuste de brilho/contraste
No 3D Preset, eu testo alguns padrões, mas a sugestão prática para vascular é:
Entrar em Soft Tissue
Na segunda página, usar presets voltados para vascular
O meu favorito aqui é o Standard, bem parecido com o que muitos laboratórios entregam
Depois disso, eu ajusto brilho/contraste para destacar as estruturas que quero ver (artérias, pele, etc.).
5) Como retirar ossos no 3D (duas maneiras)
A) “Caveirinha” (remoção automática de osso)
Clico na caveirinha e seleciono um osso (ex.: vértebra)
O OsiriX tenta remover o osso automaticamente
Ajuste avançado:
Option + caveirinha para configurar limite/intervalo de corte do osso
Problema comum mostrado no vídeo:
Como a densidade do osso pode ser próxima da densidade do contraste, às vezes ele remove artérias contrastadas junto
Se ficar ruim, eu uso Edit → Undo e tento outros valores (é tentativa e erro)
B) Tesoura (minha preferência)
Eu uso a tesourinha para cortar manualmente as estruturas que não quero
Seleciono a área e aperto Delete para apagar
Dicas práticas:
Tem que “lapidar” em vários ângulos (rotacionar o 3D e repetir)
Se apagar algo errado: Tab restaura o que foi removido naquela região/seleção
No final, dá para deixar a imagem bem mais “limpa”, mostrando principalmente a aorta e os vasos de interesse.11min
Volume vs Surface RenderingNeste vídeo eu explico, de forma prática e direta, a diferença entre os dois principais tipos de reconstrução 3D do OsiriX:
3D Volume Rendering
Baseado em voxels/pixels (densidade)
Permite ajustar cor, transparência, brilho/contraste e visualizar diferentes "camadas" (osso, vasos, partes moles) rapidamente
Ideal para análise e avaliação dinâmica da imagem
3D Surface Rendering
Converte o volume em uma representação vetorial/matemática (superfície)
Mantém boa definição ao ampliar e é mais adequado para exportação e uso em outros softwares 3D (ex.: OBJ)
Útil quando você precisa de um modelo 3D para manipulação externa (ex.: planejamento/3D)
Também faço uma analogia com Photoshop (pixel) vs Illustrator (vetor) para facilitar o entendimento do conceito.13min
3D Surface vs Volume RenderingNesta aula eu explico a diferença entre os dois principais tipos de reconstrução tridimensional do OsiriX: 3D Volume Rendering e 3D Surface Rendering. Apesar de ambos gerarem imagens 3D, o princípio de funcionamento, o tipo de resultado e a finalidade de uso são bem diferentes.
1) Conceito: pixels/voxels (Volume) vs vetorial (Surface)
Volume Rendering (baseado em voxels)
A tomografia gera um volume composto por "pontinhos":
pixels (2D) e voxels (3D)
Cada voxel tem características como densidade.
No Volume Rendering, o OsiriX usa esses voxels e permite aplicar:
cor
opacidade/transparência
ajustes por densidade
Resultado: uma imagem 3D muito "maleável" para avaliação, onde você consegue ir revelando camadas (pele, subcutâneo, veias, músculos, ossos etc.) apenas ajustando transparência/contraste.
Surface Rendering (imagem vetorial / matemática)
No Surface, o OsiriX "transforma" o volume em uma representação vetorial (uma descrição matemática).
Você define um limiar (threshold) de densidade: o OsiriX cria uma superfície baseada nesse corte.
O resultado tende a ser excelente para:
exportar
usar em softwares 3D
modelagem / impressão 3D
E uma característica importante mostrada no vídeo: ao dar zoom, a superfície não depende de pixels como o Volume Rendering — ela é desenhada por linhas/formas matemáticas.
2) Exemplo no OsiriX: Volume Rendering
Uso um caso simples de membro inferior apenas para demonstrar o princípio.
Abro o 3D Volume Rendering
Faço um crop para reduzir o bloco
Mostro o impacto de mexer no contraste/transparência:
estruturas menos densas ficam transparentes primeiro
revelando progressivamente camadas mais profundas
Isso é a grande força do Volume Rendering: explorar e avaliar o volume com ajustes rápidos.
3) Exemplo no OsiriX: Surface Rendering
Abro o 3D Surface Rendering
Escolho fazer com apenas uma superfície (mais didático)
Defino um ponto limite de densidade (threshold)
No exemplo, com esse limiar ele extrai bem os ossos (mais densos)
Comentário do vídeo: dá para ajustar configurações para chegar em superfícies mais "perfeitas", dependendo do objetivo.
4) Analogia com Photoshop e Illustrator (para entender a diferença)
No vídeo eu faço uma comparação:
Photoshop: imagem feita por pixels
se você ampliar muito, você começa a ver os "quadradinhos/pontinhos"
você consegue mexer com brilho/contraste com grande flexibilidade
Illustrator: imagem vetorial
você "traça" a imagem e ela vira linhas/formas matemáticas
ao ampliar, você não vê pixels — vê curvas/linhas definidas matematicamente
Essa lógica é parecida com:
Volume Rendering ↔ "pixel/voxel" (mais maleável para visualização)
Surface Rendering ↔ "vetorial" (melhor para exportar e trabalhar em 3D externo)
5) Quando usar cada um (como no vídeo)
Volume Rendering
Melhor para avaliação e manipulação dinâmica da imagem:
ajustar contraste/opacidade
explorar diferentes estruturas rapidamente
Surface Rendering
Melhor quando você precisa de um objeto 3D "matemático" para:
exportar
editar em software 3D
aplicações como modelagem (ex.: prótese / planejamento) e manipulações externas
6) Exportando o Surface (OBJ) e abrindo em software 3D
No final eu mostro:
Export do Surface em um formato comum (ex.: OBJ)
Abrindo esse arquivo em um software 3D (não médico) para demonstrar que:
dá para aplicar cores
editar
manipular a malha e criar diferentes efeitos/visualizações
O objetivo é deixar clara a diferença entre os dois modos de reconstrução 3D do OsiriX.13min
Por que exportar não salva lapidaçãoNesta aula eu explico um ponto que parece simples, mas gera muita confusão no OsiriX: como salvar o trabalho de “lapidação” (recortes) feito em um Volume Rendering 3D, de forma que você consiga continuar editando depois.
O exemplo é uma angiotomografia de um paciente com endoprótese. Eu crio um 3D Volume Rendering, aplico um preset vascular e começo a “esqueletizar” a imagem removendo estruturas ao redor (ossos e vasos indesejados) usando a tesoura e a tecla Delete. Também mostro que, se você fizer um corte errado, dá para cancelar com ESC.
O grande ponto: “exportar” não é o mesmo que “salvar para continuar editando”
No OsiriX existem várias formas de exportar o que você está vendo, mas a maioria delas não preserva a possibilidade de continuar lapidando depois.
O que NÃO serve para continuar editando
Se você estiver no 3D (Volume Rendering) e fizer:
File → Export to Movie
✅ bom para aula/apresentação
❌ vira apenas um vídeo rodando a cena
Export JPEG / Export TIFF
✅ gera uma imagem do que está na tela
❌ não dá para voltar a editar os recortes
Export to DICOM Files (a partir do 3D)
❌ aqui está uma armadilha comum: o OsiriX pode gerar uma série animada (como um “movie” em DICOM), ou seja, você obtém uma rotação da imagem, mas não mantém as ferramentas nem a lapidação para retrabalho
No vídeo, eu mostro isso: quando exporto direto do 3D, o resultado abre como um objeto que você até consegue rodar, mas não consegue continuar cortando, porque não tem mais as ferramentas (tesoura etc.).
A forma correta de salvar o “3D lapidado” para continuar depois
O que realmente guarda seu trabalho (os recortes) é o dataset original (os cortes axiais) — porque os recortes que você faz no VR aparecem como alterações/reflexos também na série axial.
Como fazer (passo a passo)
Faça sua lapidação no 3D Volume Rendering (tesoura + Delete)
Vá em Window e abra/olhe a imagem axial do exame
Você vai ver que os cortes/recortes apareceram nos axiais
Agora, na série axial, faça: File → Export → DICOM Files
Exporte a série inteira (do começo ao fim) e dê um nome (no vídeo: “3d volume lapidado”)
Resultado
Quando você abrir essa nova série exportada (“3d volume lapidado”), todos os cortes continuam lá
Aí você pode:
Criar um novo Volume Rendering a partir dessa série já trabalhada
Aplicar novamente o preset (ex.: “standard”/vascular)
E continuar lapidando (cortar mais osso, ajustar detalhes, fazer zoom etc.)
Dicas práticas citadas no vídeo
Para lapidar melhor: procure ângulos diferentes, inclusive ângulos “inusitados” que facilitam remover estruturas.
Para detalhes finos: faça zoom/ampliação para atingir áreas mais delicadas.
No final, você consegue uma aorta/endoprótese esqueletizada, com mínima interferência óssea, pronta para visualização de qualidade.11min
Fly-through: câmera 3DNesta aula eu mostro como fazer fly-through no OsiriX, uma reconstrução 3D em que você cria um caminho (trajeto) e a câmera percorre esse caminho, gerando um vídeo excelente para apresentações.
O exemplo é um caso interessante de leiomiossarcoma de membro inferior, com origem na camada muscular da veia (leiomiossarcoma venoso). No exame, há múltiplas lesões ao longo do trajeto e eu quero guiar o observador pelas áreas principais — incluindo regiões no meio do trajeto e uma relação/continuidade próxima à artéria tibial posterior.
1) Abrindo o Fly-through e ajustando a visualização
Eu localizo o ícone do Fly-through e abro a ferramenta
Seleciono o modo GPU (usando a placa gráfica)
Ajusto brilho e contraste para visualizar:
um pouco do músculo
e as lesões venosas com melhor definição
2) Criando os “passos” (pontos de câmera)
Com a janela do fly-through aberta, eu começo a criar as imagens-chave (keyframes):
Defino a imagem inicial como o primeiro passo
Rodo um pouco o volume e ajusto o zoom para focar a primeira lesão → adiciono o 2º passo
Crio um 3º passo para destacar outra lesão
Nesse ponto, eu ajusto brilho/contraste para melhorar a visualização
Desço mais e rodo um pouco para mostrar as lesões intermediárias → mais passos
Crio uma imagem final, totalizando 6 imagens/pontos no trajeto
Esses pontos funcionam como “marcos” que a câmera vai atravessar no vídeo.
3) Gerando o vídeo (frames e spline)
Depois de definidos os passos:
Escolho 300 frames (quadros)
Ativo Spline, para a câmera fazer uma transição mais suave (curva mais natural)
Clico para calcular as imagens
Preview (Play)
O botão Play permite visualizar como o movimento vai ficar
Não necessariamente em tempo real, porque ele está calculando frame a frame
4) Exportando em vídeo (QuickTime)
Eu peço para exportar em QuickTime
Seleciono a opção de melhor qualidade
Salvo o arquivo e o OsiriX exporta o fly-through navegando o 3D conforme os passos criados
5) Dica sobre fluidez: frames por segundo
No vídeo eu explico:
Para sensação de movimento, pensamos em ~24 frames por segundo
300 frames dá algo em torno de 10 segundos de vídeo fluido (na ideia)
Se o resultado ficar mais “lento” (com impressão de pausas), dá para deixar o vídeo um pouco mais rápido na reprodução para ficar mais natural6min
4. MPR e Centerline
Centerline (3D Curved MPR)Nesta aula eu faço uma introdução ao Centerline no OsiriX, usando o 3D Curved MPR para medir o comprimento/extensão da artéria ilíaca em um caso de aneurisma de ilíaca.
A proposta é mostrar o básico: como desenhar um centerline manual (mais preciso que o automático), como conferir se ele está realmente no centro do vaso e como usar os modos Stretched e Straightened para medir distância.
1) Abrindo o 3D Curved MPR
Seleciono o dataset arterial (mais imagens e contraste mais denso)
Abro em: roda dentada → 3D Curved MPR
O 3D Curved MPR usa:
3 janelas do 3D MPR (axial, coronal, sagital)
e uma 4ª janela (Curved) onde o trajeto aparece
Ajusto o janelamento para vascular usando Bone
Dica do vídeo: é melhor entender bem o 3D MPR antes do 3D Curved, para não se confundir com os planos.
2) Criando o Centerline manual (pontos no centro do vaso)
Dou zoom para trabalhar com imagem maior
Aperto barra de espaço para tirar os eixos da frente
Seleciono a ferramenta de trajeto do centerline
Vou clicando e colocando pontos no centro do vaso ao longo do percurso
Após 3 pontos, a 4ª janela já começa a reconstruir o Curved
Continuo descendo e marcando:
aorta → ilíaca comum → ilíaca externa (trajeto principal)
3) Identificando ramos e conferindo posição (bolinha verde + MIP)
Ao passar o mouse na janela do Curved, uma bolinha verde nas outras janelas mostra onde você está no vaso
Eu uso MIP (Maximum Intensity Projection) para aumentar a espessura do corte e enxergar melhor a anatomia
Assim fica claro onde está a saída da ilíaca interna e a continuação para a ilíaca externa
Eu também rodo a imagem para confirmar pela anatomia
4) Stretched vs Straightened (e correção do centerline)
Stretched: mostra o vaso curvo com o centerline, útil para corrigir pequenas imperfeições
Eu rodo para checar se a linha verde está sempre no centro do vaso
Straightened: “estica” o vaso, facilitando a leitura e a medida em linha reta
5) Cortes perpendiculares (A, B, C) e o que eles significam
Os marcadores A, B e C correspondem às três janelas laterais
No modo Stretched, os cortes podem “cruzar” por causa da curvatura
No Straightened, tudo fica alinhado e mais fácil de posicionar
Esses cortes são sempre perpendiculares à linha verde (centerline)
6) Medindo o comprimento da ilíaca (extensão)
No Straightened, uso a régua reta
Meço do ponto escolhido (ex.: bifurcação) até o ponto na ilíaca interna/externa conforme o objetivo
No exemplo:
a medida em linha mais “reta” ficou 5,18 cm
ao considerar a curvatura, a medida pode mudar (ex.: 5,7 cm)
Mensagem final do vídeo:
Centerline é especialmente útil para medir distância/comprimento (extensão)
Os cortes perpendiculares podem ser usados para medidas de diâmetro11min
Sobreposição para medir ângulosNeste vídeo eu respondo uma dúvida sobre como medir ângulos com "sobreposição" de imagens no OsiriX, no exemplo de joelho (ortopedia). Eu testo métodos de sobreposição (como MIP e média/mean, ajustando a espessura do corte), mas explico por que isso pode borrar a imagem e dificultar a análise.
A solução mais prática e precisa no OsiriX, na maioria dos casos, é não depender da sobreposição — e sim fazer a medida de ângulo em cortes diferentes, mantendo o mesmo ROI ao navegar entre as imagens.
Tentativa de sobreposição (e limitações)
Ativar sobreposição e usar:
MIP (Maximum Intensity Projection): soma intensidades com espessura maior → pode ficar muito borrado
Mean/Média: às vezes ajuda, mas ainda pode perder nitidez dependendo do caso
Esses métodos sobrepõem várias imagens, o que nem sempre é ideal para medir ângulo com precisão.
O método que resolve: ROI persistente entre cortes (tecla Shift)
Selecione a ferramenta Angle (régua de ângulo)
Segure a tecla Shift no teclado
Enquanto mantém o Shift pressionado, faça a marcação do ângulo
Agora você pode trocar o corte/imagem e continuar a marcação (o ROI "persiste")
Finalize o ângulo no corte desejado — com mais controle e sem precisar de "transparência"
Essa dica é útil não só para ortopedia, mas também para várias medições em outras áreas (inclusive vascular), sempre que você precisa "completar" a medida usando fatias diferentes.5min
Sincronização: pré vs pós-operatórioNesta aula eu mostro como fazer sincronização de imagens no OsiriX para comparar dois exames lado a lado, como um pré-operatório e um pós-operatório (exemplo: aneurisma de aorta abdominal/ilíacas). A ideia é abrir as duas séries (geralmente a fase arterial) e sincronizar os cortes usando um ponto anatômico de referência (como o tronco celíaco).
1) Método 1: abrir dois datasets pelo 2D Viewer (seleção com Command)
No banco de dados, expanda os exames/datasets (setinha/triângulo ao lado)
Selecione o dataset arterial do pré-operatório
Segure Command e selecione o dataset arterial do pós-operatório
Abra no 2D Viewer para aparecerem duas janelas ao mesmo tempo
Nesse momento, ainda não está sincronizado: mexer em um não move o outro.
Para sincronizar:
Encontre um ponto igual nos dois exames (no vídeo, uso o tronco celíaco)
Com os dois exames no mesmo nível, clique no botão de sincronia (Sync)
Pronto: ao navegar em um exame, o outro acompanha automaticamente.
2) Método 2: abrir um exame e depois abrir o outro (Window → Database)
Abra o primeiro exame (duplo clique)
Vá em Window → Database para voltar ao banco
Abra o segundo exame (duplo clique) — ele abre ao lado do primeiro
Repita o mesmo processo:
Alinhe por um marco anatômico (ex.: tronco celíaco)
Clique no Sync
3) Observação importante
Quando você abre dois datasets dentro do mesmo exame (ex.: sem contraste e arterial), muitas vezes eles já vêm sincronizados automaticamente, porque o próprio aparelho de tomografia organiza as séries sincronizadas dentro do exame.6min
Camadas de medidas (overlays)Neste vídeo eu mostro uma dica simples e muito útil no OsiriX: além das réguas e medidas tradicionais, você pode montar uma imagem pronta para publicação usando camadas de anotação (overlays).
A ideia é importar/usar imagens em PNG com fundo transparente (por exemplo, uma flecha) e posicioná-las sobre o corte axial. Assim, você consegue:
inserir setas, ícones ou marcadores em qualquer ponto da imagem,
ajustar tamanho e posição livremente,
escolher imagens de qualquer cor/estilo,
e salvar/exportar a imagem já com essas anotações, pronta para aula, artigo ou relatório.
Dica prática: PNG é melhor que JPEG para esse uso porque permite fundo transparente, deixando o marcador "flutuando" sobre a imagem sem um quadrado branco atrás.2min
5. Medidas e Ferramentas
Como medir vasos: Régua Reta vs CurvaNesta aula, eu mostro em detalhe duas ferramentas essenciais de medida no OsiriX: a régua reta e a régua curva (Open Polygon) — muito usadas no dia a dia, especialmente em avaliações vasculares no MPR.
Onde encontrar as ferramentas
Na barra de ferramentas, selecione a régua reta.
Clique na setinha para baixo para ver outras opções de régua.
A régua curva aparece como Open Polygon.
Régua reta: medida linear e diâmetro confiável
Clique e arraste para fazer uma medida linear (em cm).
Para medidas vasculares confiáveis, o ideal é medir em um plano perpendicular ao vaso (não apenas no axial).
No exemplo (aneurisma de artéria ilíaca), o passo a passo é:
Ajustar o corte nos planos (ex.: plano roxo) para ficar transversal ao vaso em diferentes janelas.
Confirmar a “bolinha perfeita” (corte verdadeiramente perpendicular).
Usar o janelamento bone para melhor identificar cálcio e o lúmen.
Ocultar eixos/apontadores com a barra de espaço e então medir com a régua reta.
Régua curva (Open Polygon): medida de extensão
Excelente para medir comprimento/extensão ao longo do trajeto do vaso.
Ajusto o MIP para visualizar melhor a ilíaca e o aneurisma, faço zoom e ajusto brilho/contraste.
Para criar a régua curva:
Vá clicando e colocando pontos mais distantes entre si para acomodar a curvatura.
Clique na última bolinha para finalizar.
Ajuste fino:
Você pode clicar em qualquer bolinha e reposicionar para adequar à anatomia.
Atenção: se você coloca pontos muito próximos, o software pode “ignorar” a curva, prejudicando a medida. Prefira pontos mais espaçados, conforme a anatomia.
Como apagar réguas e pontos
Apagar uma régua: selecione a régua e pressione Delete.
Apagar tudo da tela: Command + Delete.
Remover ponto da régua curva:
Se for o último ponto, pressione Delete.
Para apagar um ponto no meio: clique/segure a bolinha desejada e pressione Delete.7min
Medir em fotos: importar e recalibrarNesta aula eu mostro como fazer medidas em fotos (JPEG/BMP etc.) dentro do OsiriX e como recalibrar a escala para que as medições deixem de aparecer em pixels e passem a aparecer em centímetros — permitindo medir distâncias, dimensões e até área (cm²).
1) Habilitar importação de imagens (não apenas DICOM)
Por padrão, o OsiriX vem configurado para importar somente DICOM.
Para importar fotos:
Vá em Preferences (Preferências)
Abra a seção Database (Banco de Dados)
Desmarque a opção “Import DICOM File Format Only”
Com isso, o OsiriX passa a aceitar também arquivos de imagem.
2) Importar a foto para o banco de dados
Vá em File (Arquivo) → Import Files (Importar arquivos)
Selecione a foto e importe
No exemplo do vídeo, eu importo duas fotos e abro a que contém uma régua/escala.
3) Por que aparece “pixels” e como resolver
Se você usar a régua em uma foto sem escala DICOM, o OsiriX mostra a medida em pixels (os “pontinhos” da imagem).
Isso não ajuda quando você precisa, por exemplo, calcular:
tamanho em centímetros
dimensões de uma lesão
área em cm²
4) Recalibrar: ensinar ao OsiriX o que é 1 cm
O processo é:
Selecione a régua reta
Meça um trecho conhecido (no vídeo, 1 cm na régua impressa da própria foto)
No exemplo, o OsiriX mostra que 141 pixels = 1 cm
Clique duas vezes em cima da medida e escolha Recalibrate (Recalibrar)
Defina Distance in centimeters = 1 (equivalente a 10 mm)
A partir desse momento, todas as réguas passam a retornar medidas em cm, e não em pixels.
5) Medir distância e dimensões
Depois de recalibrar:
a régua passa a mostrar medidas como 13 cm
você pode medir uma lesão/úlcera em 2 cm x 1,5 cm, por exemplo
6) Medir área com o pincel (cm²)
Para calcular a área:
Selecione a ferramenta de pincel/brush
Ajuste a espessura (no vídeo, eu aumento para 20)
“Pinte” a úlcera/lesão
O OsiriX retorna a área exata em cm² (no exemplo: 3,8 cm²)
7) Quando isso é útil
Essa recalibração pode ser aplicada a qualquer imagem importada (JPEG, BMP etc.), especialmente quando algum laboratório entrega imagens fora do DICOM.
Você pode usar uma referência conhecida para calibrar:
uma régua na própria foto
uma medida corporal (ex.: “mamilo a mamilo”)
uma medida que você faça no paciente e insira no OsiriX5min
Medir área de úlcera por fotoNeste vídeo eu mostro, a pedido do professor Eliud, como fazer a avaliação de uma úlcera por fotografia usando OsiriX (a mesma lógica vale para o Horos). A ideia é transformar uma foto (JPEG) em uma imagem calibrada, para medir área em cm² e acompanhar a evolução da ferida ao longo do tempo.
1) Liberar importação de JPEG no OsiriX
Por padrão, o OsiriX costuma permitir apenas DICOM. Para importar foto:
Vá em Preferences (Preferências)
Entre em Database (Banco de Dados)
Desmarque: Import only DICOM files (Importar somente arquivos DICOM)
⚠️ Observação: “JPEG” aparece em vários lugares das preferências (inclusive ligado à compressão DICOM). O ajuste correto é no Database, na opção de importar apenas DICOM.
2) Importar a foto
Arraste a foto para o banco de dados ou use a opção de importar arquivos
Dê duplo clique para abrir a imagem
3) Calibrar: dizer ao OsiriX quanto vale 1 cm
Como a foto não é DICOM, o OsiriX mede em pixels (ex.: 105 pixels).
Para converter para centímetros:
Use a régua reta (Length/Comprimento) e meça 1 cm na referência da foto (régua)
Clique com o botão direito na medida
Selecione Recalibrar resolução
Informe que aquela distância vale 1 cm
Depois disso, todas as medidas passam a sair em cm, não em pixels.
(Se necessário, você pode dar zoom para calibrar com mais precisão e recalibrar novamente.)
4) Medir a área da úlcera (cm²)
Você pode medir área de várias formas. No vídeo eu mostro duas:
A) Polígono fechado (Closed Polygon)
Vá colocando os pontos ao redor da úlcera
No último ponto, clique duas vezes para fechar
O OsiriX retorna a área (ex.: ~10 cm² no exemplo)
B) Pincel (Brush)
Ajuste o tamanho do pincel
“Pinte” a área da úlcera
Clique duas vezes para finalizar e obter a área (ex.: ~9,7 cm² no exemplo)
5) Para que isso serve
Com a mesma técnica, dá para avaliar várias fotos ao longo do tempo e comparar se a ferida está melhorando ou piorando.
6) Referências para calibração (além da régua)
Se a foto não tiver régua, você pode calibrar usando um objeto de tamanho conhecido, por exemplo:
moeda (sabendo o diâmetro)
cartão de crédito (tamanho padrão)
⚠️ Cuidado com seringas: nem sempre a marcação em mL equivale a centímetros — tenha uma seringa igual ao lado para confirmar a medida real.8min
Surface Length PluginNesta aula rápida, apresentamos o plugin Surface Length para OsiriX, uma ferramenta desenvolvida para medição de comprimento sobre superfícies em reconstruções 3D. Veja uma visão geral do plugin e de como ele complementa as ferramentas de medida do OsiriX no seu fluxo de trabalho.
O plugin é gratuito e está disponível no site de software do autor, software.amato.com.br.1min
Surface Length 3DConheça o plugin Surface Length 3D para OsiriX, uma ferramenta desenvolvida para medir comprimentos sobre superfícies em reconstruções 3D. Nesta aula rápida, mostro como o plugin funciona na prática e como ele complementa as ferramentas de medida nativas do OsiriX.
O plugin é gratuito e está disponível no site de software do autor, software.amato.com.br.3min
6. Segmentação
Segmentação automática da aortaNesta aula eu mostro como fazer segmentação automática da aorta (e outras estruturas) no OsiriX, para transformar um dataset “poluído” em uma imagem limpa, pronta para reconstruções 3D (Volume Rendering) bem bonitas.
A lógica do método é:
Selecionar um ponto com bom contraste e criar um ROI que cresce em 3D (para cima e para baixo na série)
Editar o ROI (fechar orifícios e dilatar) para melhorar a seleção
Transformar tudo fora do ROI em densidade negativa (como ar), facilitando o 3D
Gerar o 3D Volume Rendering e finalizar removendo o que sobrou (tesoura + Delete)
1) Criar a segmentação 3D da aorta (Grow Region)
Ajusto um janelamento vascular
Dou zoom em um ponto onde a aorta está bem opacificada
Vou em ROI → Grow Region 2D/3D Segmentation
Escolho 3D Grow Region
Ajuste do intervalo (HU)
O OsiriX seleciona um intervalo em HU acima/abaixo do ponto clicado
Eu testo valores menores e maiores para entender o efeito
No exemplo, 150 funciona bem para selecionar a aorta e ramos com densidade um pouco menor
Depois eu mando computar a seleção e verifico navegando para cima/baixo que foram incluídos:
tronco celíaco
mesentérica superior
renais
2) Refinar o ROI: fechar buracos e dilatar
Como aparecem orifícios dentro da seleção:
ROI → Brush → Closing
Fecho orifícios com tamanho ≤ 4 voxels
Para não ficar só no lúmen:
ROI → Brush → Dilatation
Dilato 2 voxels para incluir um pouco além do contraste (adventícia)
3) Pintar tudo fora do ROI com densidade negativa
ROI → Set Pixel Value
Seleciono Outside ROIs
Aplico valor negativo (no vídeo: -2048, poderia ser -1024)
Assim, tudo que está fora da aorta vira “ar”, o que deixa o 3D muito mais simples de montar.
(No exemplo é um exame grande, com ~2600 imagens, então o cálculo pode demorar.)
4) Gerar o 3D e lidar com exame grande (Clip vs Resample)
Vou em 3D Volume Rendering
Como o dataset é grande, aparece um comportamento relacionado ao dynamic range
Mostro que dá para:
Resample (comprimir a variação)
ou Clip (cortar extremos) — escolho Clip por ser mais rápido
Resultado: uma aorta segmentada com ramos bem visíveis e uma imagem 3D “limpa” para trabalhar.
5) Finalização rápida: tesoura + Delete
Se ainda sobrar:
vértebras/bacia
coração (pode pegar contraste junto)
Eu finalizo com:
tesoura no 3D
seleciono e aperto Delete
É um pós-processamento rápido e o resultado fica bem impressionante.9min
Segmentação da aorta v2Nesta aula eu demonstro um fluxo automático de segmentação da aorta (e estruturas vasculares) no OsiriX, para transformar um dataset “poluído” (com ossos, órgãos e outras estruturas) em uma imagem limpa, ideal para reconstruções 3D (Volume Rendering) bem bonitas.
A ideia é: selecionar a aorta com contraste, expandir essa seleção em 3D, corrigir o ROI (fechar orifícios e dilatar) e depois pintar tudo fora do ROI com densidade negativa (como ar). Com isso, o 3D fica muito mais fácil de gerar e de “lapidar”.
Visão geral do método
Selecionar a aorta com contraste usando um ROI 2D
Expandir para 3D (para cima e para baixo na série) com Grow Region 3D
Editar o ROI:
Closing para fechar orifícios
Dilatation para incluir um pouco além do lúmen (adventícia)
Set Pixel Value (Outside ROI) para colocar densidade negativa fora da seleção
Gerar 3D Volume Rendering e finalizar com cortes rápidos (tesoura + Delete)
Passo a passo (como no vídeo)
1) Preparar a visualização
Estou na imagem axial
Ajusto um janelamento vascular (brilho/contraste) para facilitar a seleção
2) Criar a segmentação automática com ROI
Dou zoom em uma região onde a aorta tem boa densidade (bem opacificada)
Vou em ROI → Grow Region 2D/3D Segmentation
Escolho 3D Grow Region (não o 2D)
Ajuste do intervalo (HU)
O OsiriX seleciona baseado em um intervalo (ex.: X unidades de HU acima e abaixo do ponto clicado)
Eu demonstro testando valores menores (ex.: 30) e maiores
No exemplo, 150 funcionou bem para pegar também ramos com densidade um pouco menor
Depois, eu mando o OsiriX computar a seleção 3D e consigo navegar para cima/baixo verificando:
tronco celíaco
mesentérica superior
renais
selecionados junto com a aorta.
3) Corrigir falhas do ROI (orifícios) e refinar a seleção
Como surgem “buracos” dentro da seleção:
Vou em ROI → Brush → Closing
Fecho orifícios com tamanho ≤ 4 voxels
Depois, para não ficar só no lúmen:
Vou em ROI → Brush → Dilatation
Dilato 2 voxels (no exemplo) para “engordar” um pouco a seleção
4) Pintar tudo fora do ROI com densidade negativa
Agora vem o pulo do gato para “limpar” o dataset:
Em ROI → Set Pixel Value
Escolho:
Outside ROIs
Um valor negativo (ex.: -2048; poderia ser -1024 também)
Assim, tudo que está fora do ROI vira “ar” (densidade negativa), facilitando o 3D
No vídeo eu comento que o exame é grande (cerca de 2600 imagens), então esse cálculo pode demorar um pouco.
5) Gerar o 3D e resolver o “dynamic range” (exame grande)
Após o processamento, eu removo/oculto o ROI para visualizar o resultado “limpo”
Vou em 3D Volume Rendering
Como o exame é muito grande, aparece uma situação em que o escopo/dynamic range fica exagerado
Eu mostro duas opções:
Resample (comprime a variação)
Clip (corta extremos) — escolho Clip por ser mais rápido para o computador
Resultado: uma aorta segmentada com ramos bem visíveis e um 3D bem mais “trabalhável”.
Finalização rápida (pós-processamento)
Mesmo com segmentação automática, podem sobrar:
um pouco de coração (por contraste)
vértebras / bacia
Aí eu uso:
Tesoura no 3D
seleciono e aperto Delete
Fazendo cortes por ângulos diferentes, dá para “esculpir” rápido e chegar num resultado bem limpo.9min
Segmentação da via aéreaNeste vídeo eu mostro como fazer a segmentação da via aérea a partir de uma ressonância magnética usando o OsiriX. O princípio é semelhante à segmentação aórtica, porém “invertido”: em vez de buscar uma região muito contrastada, buscamos uma região sem densidade (o ar).
Observação: em RM, muitas vezes o exame tem poucas imagens (ex.: 32), o que reduz a qualidade do 3D. Mesmo assim, ainda dá para segmentar e obter um modelo útil.
Passo a passo (fluxo do vídeo)
1) Selecionar o “ar” com Grow Region
Abrir o exame
Ir em ROI → Grow Region
Clicar em uma área de ar e mandar Compute para selecionar para frente e para trás
Se a seleção vier grande demais, eu apago e ajusto:
Delete All ROIs
Reduzir o intervalo de seleção para pegar melhor a área de baixa densidade
No vídeo, uso valores como 20 e depois 30 para melhorar a seleção
Compute novamente
2) Corrigir os “furinhos” (Closing)
Após a seleção do ar, normalmente aparecem falhas internas:
ROI → Brush ROIs → Closing
Ajustar o raio (no vídeo, usei 8 como referência)
Isso fecha os orifícios e melhora o contorno da via aérea.
3) Pintar o que está fora do ROI (valor negativo)
Para “limpar” o dataset:
Selecionar a opção para aplicar nos ROIs
Pintar Outside ROIs com um valor negativo (fica “preto”, como ar)
Resultado: o que não interessa é “removido” visualmente.
4) Dar densidade alta para o que está dentro do ROI (valor positivo)
Agora eu reforço a via aérea como estrutura sólida:
Pintar Inside ROI com valor positivo alto (no vídeo: 1000)
Isso deixa a via aérea bem destacada para o 3D.
5) Gerar o 3D e remover o ar externo
Abrir 3D Volume Rendering
O modelo 3D aparece (via aérea + ar externo)
Usar a tesoura para apagar o que é externo ao paciente (ar fora da cabeça)
Seleciona → Delete
Pode rotacionar o 3D para conferir o que está cortando
Fica só a via aérea em 3D.
Como calcular o volume da via aérea (ROI Volume)
Voltar para a janela das imagens (sagital/axial)
Delete All ROIs para visualizar apenas a via aérea “densificada”
Reselecionar com ROI → Grow Region → Compute (agora fica rápido porque tudo está com densidade uniforme)
Ir em ROI → ROI Volume e calcular
No exemplo do vídeo, o volume calculado foi 55 cm³.6min
Remoção de osso (caveirinha)No OsiriX 7.0 (64-bits), a ferramenta de retirada de osso (“caveirinha”) continua disponível e pode ser ajustada e personalizada na barra de ferramentas:
Ajustar a remoção de osso
Option + clique na caveirinha abre as configurações.
Você pode aumentar/diminuir o limiar (densidade) para retirar:
valores mais “altos” → tende a pegar apenas estruturas mais densas
valores mais “baixos” → remove mais coisa (maior risco de “comer” vasos contrastados)
Usar a ferramenta
Depois de ajustar, clique na caveirinha e aplique na imagem para remover os ossos conforme o limiar escolhido.
Colocar ou remover a caveirinha da barra
Clique com o botão direito em uma área vazia da barra de ferramentas → Customize Toolbar.
Arraste a caveirinha para incluir ou puxe para fora para remover.
Assim você deixa a barra só com o que usa no dia a dia.1min
7. Cirurgia Vascular
Planejamento endovascular completoNesta apresentação, o Dr. Daniel Benitti fala sobre a importância do planejamento na cirurgia vascular, especialmente nos procedimentos endovasculares da aorta, e como o OsiriX se torna uma ferramenta central para medições precisas de diâmetro e comprimento, reduzindo improvisos e evitando erros de sizing (oversize insuficiente ou excessivo, com risco de endoleak e outras complicações).
O vídeo também traz uma discussão sobre como o corte axial pode enganar quando não está perpendicular ao vaso, gerando imagens elípticas e medidas incorretas. A proposta é controlar os eixos com reconstruções multiplanares (3D MPR) para obter o corte transversal real (“bolinha perfeita”) e, para medir extensão, utilizar a técnica com MIP (aumento da espessura do corte) após alinhar o eixo do vaso.
Principais pontos abordados
Por que medidas no axial podem estar erradas quando o vaso está em corte oblíquo
Relação entre medida incorreta e erro de oversize (subdimensionar vs. superdimensionar)
3D MPR: criar o “plano do vaso” (sem depender de axial/coronal/sagital fixos)
Comprimento da aorta: limitações de medir “em linha reta” e por que o MIP ajuda na prática
Discussão sobre Centerline e diferenças entre medidas e realidade intraoperatória
Importância de reduzir contraste e radiação com planejamento prévio detalhado
Demonstração/conceito de identificação da artéria de Adamkiewicz no OsiriX para planejamento torácico
Experiência prática relatada: uso de pequenos volumes de contraste e fluxo de procedimento guiado por planejamento
Presente e futuro do OsiriX: melhorias no 3D Curved MPR, angioscopia virtual, possibilidade de subtração digital a partir de angiotomografia e exemplos de controle por movimentos (Kinect) discutidos na apresentação
Perguntas e respostas: aplicação no sistema venoso (ex.: Nutcracker/Cockett), limitações em fístulas, papel do planejamento nos procedimentos secundários, por que a plataforma Mac, versões aprovadas pelo FDA, OsiriX Pro, TeraRecon, e comentários sobre não substituir programação por exame físico47min
EVAR PlanningNesta aula do módulo de Cirurgia Vascular, apresentamos uma visão geral do planejamento de EVAR (tratamento endovascular do aneurisma de aorta) utilizando o OsiriX/Horos. Veja como o visualizador DICOM pode auxiliar na avaliação da angioTC para o planejamento endovascular.5min
Planejamento do arco em CNesta aula eu demonstro como usar o OsiriX para planejar os ângulos do arco em C no intraoperatório, usando a tomografia no pré-operatório. O objetivo é encontrar o melhor ângulo para abrir estruturas como a bifurcação ilíaca (ilíaca interna vs externa) e, quando necessário, ajustar também o ângulo para visualizar as renais.
1) Ferramenta usada: 3D Volume Rendering
Para calcular ângulos, eu utilizo o 3D Volume Rendering.
Ajusto o volume (crop/resolução) para usar menos memória quando necessário.
A imagem inicial corresponde ao ântero-posterior (AP), como se fosse a visão padrão da arteriografia no arco em C, com sobreposições típicas (ex.: ilíaca interna sobre a externa).
2) Encontrando o melhor ângulo para as ilíacas
Eu rodo o volume até “abrir” a bifurcação e separar claramente a ilíaca interna da ilíaca externa.
No exemplo do vídeo:
Bifurcação ilíaca direita: melhor visualização com cerca de +38° (faixa ~35–40°)
Bifurcação ilíaca esquerda: melhor visualização com cerca de −43°
Ponto-chave: o OsiriX mostra o ângulo no canto inferior (valores em graus).
Atenção à referência do equipamento: no arco em C, a posição AP costuma ser 0°. No OsiriX, é importante entender isso para não confundir com outras referências (ex.: reset view).
3) Ajuste adicional (obliquidade + cranial/caudal)
Além do oblíquo direita/esquerda, às vezes você precisa inclinar o arco em cranial/caudal para “descolar” melhor as estruturas. No exemplo, eu mostro um caso em que:
o oblíquo fica por volta de −50°
e o ângulo superior/inferior fica em torno de −36°
4) Padronização dos termos com SI e LR (como o OsiriX mostra)
Para evitar confusão entre equipes e hospitais, eu padronizo os termos do jeito que o OsiriX apresenta:
Posição AP padrão: SI = 0° (superior/inferior, crânio-caudal) e LR = 0° (left/right, oblíquo)
Oblíquo cranial: SI maior que 0°
Oblíquo caudal: SI menor que 0°
Oblíquo para a direita: LR menor que 0°
Oblíquo para a esquerda: LR maior que 0°
Ou seja: você posiciona o volume no OsiriX como quer ver no arco em C, anota SI e LR, e leva esses valores para o intraoperatório.9min
Estenose de carótida na angioTCNesta aula eu demonstro como avaliar carótidas pela angiotomografia (angioTC) usando o OsiriX, desde a visão geral no 3D Volume Rendering até a mensuração da estenose em corte adequado, comparando os métodos NASCET e ECST. O caso principal mostra uma oclusão de carótida interna à direita e uma estenose de carótida interna à esquerda, com artérias vertebrais vicariantes bem desenvolvidas. No final, mostro um segundo caso com tumor glômico para ilustrar como o 3D ajuda no diagnóstico e no planejamento.
1) Visão geral no 3D (antes de medir)
Percorro as imagens axiais para reconhecer arco aórtico e troncos supra-aórticos
Abro 3D Volume Rendering e aplico um preset vascular (ex.: Soft Tissue / Standard)
No 3D já fica evidente:
Oclusão da carótida interna direita
Estenose na carótida interna esquerda
Vertebral vicariante (com maior calibre para suprir a circulação)
Também demonstro o uso de Crop para isolar a circulação intracraniana e visualizar melhor os vasos.
2) Confirmando a oclusão (MPR)
No lado direito, em MPR:
Rotaciono os eixos e mostro que não aparece carótida interna em nenhum ângulo no ponto esperado da bifurcação
Confirmação prática de oclusão.
3) Encontrando o corte ideal da estenose (lado contralateral)
Para medir a estenose corretamente:
Faço zoom
Subo/desço até a bifurcação
Rotaciono para obter a melhor visualização da placa (cálcio + lúmen contrastado)
Ajusto brilho/contraste para diferenciar:
contraste
cálcio
parede do vaso (estimada)
4) Duas formas de medir: NASCET e ECST (com exemplo numérico)
Eu mostro os dois métodos clássicos:
NASCET
Usa o diâmetro distal à lesão (carótida interna “normal” após a placa)
Compara com o diâmetro no ponto de estenose
ECST
Usa o diâmetro estimado do bulbo/vaso no local da lesão
Compara com o diâmetro no ponto de estenose
No exemplo do vídeo:
Diâmetro distal (NASCET): 5 mm
Diâmetro estimado no local (ECST): 8 mm
Diâmetro no ponto de estenose: ~1–1,2 mm (mostro as medidas na tela)
Aplicando as fórmulas:
NASCET ≈ 76%
ECST ≈ 85%
Importante: existe diferença relevante entre os métodos, porque o “diâmetro de referência” é diferente.
5) Atenção: não usar MIP para medir estenose carotídea
Eu reforço um alerta:
MIP pode deixar a imagem bonita, mas pode subestimar a estenose se houver “filete” de contraste passando ao lado da placa ou sobreposição que engane o lúmen real.
Para mensurar estenose, evite MIP.
6) Utilidades práticas para planejamento (aberta e endovascular)
Com o 3D e o corte correto, dá para:
Estimar a altura da lesão em relação à mandíbula (planejamento de acesso na cirurgia aberta)
Avaliar se a carótida é retilínea o suficiente para acomodar filtro (endovascular)
“Limpar” o campo com a tesoura para enxergar melhor o arco supra-aórtico e prever a facilidade de cateterização
7) Caso adicional: tumor glômico
Mostro um segundo caso onde:
O 3D evidencia um tumor glômico grande
Na axial, o tumor parece envolver carótida interna e externa (característica de caso cirúrgico difícil)
Também explico rapidamente a escolha entre Resample e Clip quando o software avisa sobre faixa dinâmica/tons de cinza:
Resample: “condensa” valores para caber na escala (mais pesado)
Clip: corta extremos (mais rápido)16min
Angiografia cerebral 3DNeste vídeo eu mostro como fazer uma angiografia cerebral no OsiriX a partir de um exame com fase arterial bem opacificada. O caso é de uma paciente com síndrome do roubo da subclávia (aparece na reconstrução), mas o foco da aula é a visualização dos vasos intracranianos e a identificação de um aneurisma sacular.
1) Escolher o melhor dataset
Seleciono o dataset da fase arterial com maior número de imagens (no exemplo: 477)
Percorrendo os cortes, confirmo que os vasos cerebrais estão bem corados
2) Abrir o 3D Volume Rendering
Entro em 3D Volume Rendering
Começo com a reconstrução tridimensional e ajusto o ângulo de visão
3) “Limpar” o 3D para focar no que interessa (Crop)
Para trabalhar mais rápido e gastar menos memória:
Entro em Crop e ajusto a caixa (bolinhas verdes)
Corto tudo que não interessa (laterais, inferior e partes sem informação)
Faço um recorte para remover parte do crânio e conseguir enxergar “dentro da cabeça”
Isso deixa o computador mais leve e mais rápido para manipular o 3D.
4) Melhorar qualidade e desempenho: CPU vs GPU
Para melhorar a imagem 3D:
Troco o engine para GPU (Graphics Card)
A GPU joga o processamento para a placa gráfica, que é mais eficiente para cálculos 3D, deixando a reconstrução mais fluida e com melhor qualidade do que no CPU em muitos casos.
5) Avaliar vasos intracranianos e achar o aneurisma
Com o recorte feito:
Dou zoom
Ajusto o ângulo
Avalio o polígono de Willis (no caso, não está completo)
Identifico um aneurisma sacular no segmento M2
Posso usar a régua para medida, se necessário
6) Alternativa ao Crop: “trepanação” com tesoura
Em vez de Crop, também dá para:
Usar a tesoura para remover parte da calota craniana (“trepanação” no 3D)
Isso permite visualizar o aneurisma através da abertura
Atenção: é preciso cuidado para não cortar vasos que você quer analisar.
No vídeo eu demonstro as duas abordagens (Crop e tesoura) para chegar ao mesmo objetivo: ver claramente os vasos intracranianos e o aneurisma no 3D.8min
8. Imagem e Exportação
Subtração digital (DSA)Nesta aula eu mostro como fazer subtração digital (DSA) no OsiriX quando a arteriografia foi gravada em DICOM como imagem “crua” (sem subtração), mesmo que no aparelho ela já aparecesse subtraída.
1) Converter a arteriografia crua em subtração digital
Abra o exame no 2D Viewer
Selecione Subtract (Subtração)
Pronto: o OsiriX gera a imagem em subtração digital.
No vídeo eu demonstro isso em dois exemplos:
um exame arteriográfico gravado sem subtração
uma embolização de mioma, onde a subtração melhora muito a visualização
2) Criar uma imagem estática com a somatória das imagens
Outra técnica útil é somar todas as imagens para obter uma imagem única “consolidada” do contraste.
O ponto importante é escolher a projeção correta:
MinIP (Minimum Intensity Projection): ideal quando o contraste aparece mais escuro/invertido — assim as estruturas com contraste se acumulam na somatória.
MIP (Maximum Intensity Projection): nesse caso pode “apagar”/prejudicar o contraste, porque privilegia os valores mais altos.
Resultado: você fica com uma imagem estática com a somatória das chapas da subtração digital.3min
Exportar modelo 3D para impressãoNeste passo a passo eu mostro como transformar um exame (DICOM) em um modelo 3D exportável para impressão 3D, usando o OsiriX.
Abrir o exame e gerar o 3D (Volume Rendering)
Abrir o dataset do crânio.
Ajustar o preset para realçar osso (ex.: Bone/Standard), até visualizar bem o crânio.
“Limpar” o volume (remover tecidos que não interessam)
Usar a tesoura (Scissors) para apagar tecidos moles e estruturas indesejadas.
Opcional: usar a ferramenta automática de remoção de osso, mas aqui o método é manual.
Ajustar/cortar artefatos (ex.: espículas da prótese) para reduzir imperfeições.
Confirmar que o corte afetou o dataset
Sair da janela 3D e verificar que os cortes axiais ficaram com as regiões removidas (isso garante que o “dataset lapidado” está pronto).
Gerar o modelo vetorial (3D Surface Rendering)
Abrir 3D Surface Rendering.
Para impressão, usar 1 superfície (single surface) e definir um threshold adequado para osso.
Gerar o modelo de superfície do crânio.
Exportar para formatos de impressão/edição
Exportar em:
STL (mais comum para impressoras 3D)
OBJ (muito útil para edição/fluxos alternativos)
Observação importante: STL quase sempre precisa de tratamento antes de imprimir (fechar buracos, remover ruído, corrigir malha, etc.).
Abrir em um software de edição 3D
Importar o STL/OBJ em um editor (ex.: Meshmixer, Blender, 3D Builder, etc.).
A partir daí você pode:
Corrigir artefatos e “espículas”
Fechar buracos
Suavizar a malha
Reduzir número de polígonos
Preparar para fatiamento (slicer)5min
Converter DICOM para VTINeste tutorial eu mostro como rodar Linux dentro do Mac via máquina virtual (preferencialmente Parallels Desktop, mas o VirtualBox também funciona) para converter um dataset DICOM exportado do OsiriX em um arquivo .vti (VTK ImageData), útil por exemplo no SimVascular.
Passo a passo do fluxo:
Criar a máquina virtual e instalar Ubuntu
No Parallels: botão “+” → escolha Ubuntu → baixar (~2 GB) → instalar.
(Alternativa: VirtualBox com ISO do Ubuntu)
Instalar as bibliotecas/ferramentas necessárias no Ubuntu
Abrir o Terminal e rodar:
sudo apt-get update
Instalar a ferramenta do GDCM que faz a conversão:
sudo apt-get install libvtkgdcmtools
Exportar o exame no OsiriX como DICOM
No OsiriX: exportar o exame (idealmente anônimo) para uma pasta (no Desktop, por exemplo).
Copiar a pasta DICOM para dentro do Ubuntu
No Parallels, instalar o Parallels Tools (se necessário) e reiniciar o Ubuntu.
Arrastar a pasta exportada (com os .dcm) para o Desktop do Ubuntu.
Converter a pasta DICOM para .VTI
No Terminal, executar:
gdcm2vtk pasta_dicom saida.vti
Exemplo típico (arrastando a pasta e definindo o destino):
gdcm2vtk ~/Desktop/Exame ~/Desktop/exame.vti
Atenção ao “problema da pasta dentro da pasta”
Se o comando falhar, normalmente é porque você apontou para uma pasta “errada” (uma pasta externa que contém outra pasta onde estão os .dcm).
A solução é apontar para a pasta que contém diretamente os arquivos DICOM.
Resultado
Em vez de centenas/milhares de DICOMs, você terá um único arquivo exame.vti, geralmente menor (por remover redundâncias), pronto para uso em softwares VTK/SimVascular.10min
Burn e AnonimizarNesta aula do antigo Curso OsiriX/Horos, o Dr. Alexandre Amato mostra duas funções que parecem simples, mas fazem toda diferença no dia a dia: Burn (gravação de CD/DVD ou geração de DMG) e Anonimizar (remoção de dados do paciente antes de compartilhar ou exportar).
Você vai ver, na prática:
Como usar o Burn para gravar mídia com o exame do paciente
Como anonimizar automaticamente na gravação e reduzir tamanho com compressão em JPEG
Diferença entre gravar CD/DVD e gerar um arquivo DMG
Opções para incluir visualizadores (ex.: ISIS, multiplataforma) e exportações auxiliares (HTML/QuickTime)
Como copiar laudos, criptografar em ZIP com senha e incluir uma pasta extra (materiais, vídeos, folder)
Como usar Arquivo → Anonimizar e escolher quais campos remover (Replace e Export)
Nota de privacidade: ao compartilhar exames, anonimize corretamente e siga as regras e políticas do seu serviço.4min
9. Laudos e Rede
Como criar laudos no OsiriXNesta aula eu explico como criar laudos (Reports) no OsiriX usando o sistema nativo do programa. É um processo simples: você escolhe qual editor de texto o OsiriX vai usar (Pages, Word, TextEdit, LibreOffice etc.), cria o laudo pelo ícone de Report e pode personalizar os templates para ficar com a sua identidade (logo, layout, texto padrão).
1) Escolher o editor de texto para os laudos
No OsiriX:
Vá em Preferences (Preferências)
Entre em Database
Na parte de Reports, selecione qual programa será usado para editar os laudos
No exemplo do vídeo, aparecem opções instaladas no Mac:
Pages (Apple)
LibreOffice (gratuito)
TextEdit (padrão do macOS)
Microsoft Word (Mac)
Você pode usar qualquer um deles — o OsiriX só vai abrir o template no editor escolhido.
2) Criar um laudo pelo ícone “Report”
Abra qualquer exame
Na barra superior, clique no ícone Report
Se o ícone não estiver aparecendo:
Clique com o botão direito na toolbar → Customize Toolbar
Arraste o ícone Report de volta para a barra
Ao clicar em Report, o OsiriX abre um laudo baseado em um template. No vídeo, aparece um texto de exemplo (template padrão), que pode ser totalmente trocado.
3) Personalizar template no Pages (Pages Templates)
Quando o editor selecionado é o Pages:
Abra o Finder
Vá em Documentos → OsiriX Data → Pages Templates
Abra o template e edite como quiser (ex.: inserir logotipo, cabeçalho, layout, campos)
Depois de salvar o template:
Os próximos laudos abertos em novos exames já usam o modelo atualizado (o exame que já estava com laudo aberto mantém o template antigo).
4) Personalizar template no TextEdit (Report Template)
No exemplo com TextEdit:
Mude o editor em Preferences → Database → Reports para TextEdit
Gere um Report em qualquer exame (para ver o modelo)
Para editar o template:
Documentos → OsiriX Data → Report Template
Modifique o texto do jeito que quiser e salve
Quando você abrir um novo Report em outro exame:
Ele já vem com o template atualizado.
5) O laudo fica anexado ao exame
No fluxo do vídeo:
Você edita e salva o laudo no editor (ex.: TextEdit)
Ao fechar e voltar ao OsiriX, o laudo fica anexado ao exame
Dá para ver pelo OsiriX que o report existe e conferir pela coluna “Report” (mostrando quando o laudo foi feito)6min
Cmd-K: imagens-chave para laudoNeste vídeo eu ensino como imprimir no OsiriX de um jeito prático, usando recursos que evitam imprimir a série inteira (centenas de imagens). A ideia é selecionar somente os cortes importantes como Key Images (imagens-chave) e imprimir em PDF, além de mostrar como imprimir uma reconstrução 3D.
1) Criando Key Images (Cmd-K)
No exame (ex.: aneurisma/aorta tortuosa), eu seleciono alguns cortes relevantes e marco como Key Image:
Saída da renal esquerda → Cmd-K
Saída da renal direita → Cmd-K
Bifurcação → Cmd-K
O OsiriX destaca as Key Images com uma moldura amarela.
2) Menu de impressão e opções úteis
Vou em File → Print e ajusto:
Quantas imagens por página
Título/cabeçalho (ex.: clínica, paciente, estudo)
O que imprimir:
Série inteira (ex.: 262 imagens → pode virar dezenas de páginas)
Pular imagens (ex.: imprimir 1 a cada 10)
Intervalo (imprimir do corte X ao corte Y)
Imagem atual (somente a que está na tela)
Key Images (minha opção preferida)
No exemplo, ao imprimir Key Images, sai uma página com as 3 imagens selecionadas — excelente para documentação e laudo (ex.: ecodoppler).
3) Imprimindo reconstrução 3D
Se eu tenho uma imagem 3D bonita (Volume Rendering), posso:
A) Imprimir direto
Print da visualização 3D → sai uma imagem por página (no PDF)
B) Exportar o 3D como DICOM (frames) e imprimir selecionando imagens
Export → DICOM
Exporto, por exemplo, 10 imagens (frames)
Essas imagens aparecem no exame como uma série "pronta" (não editável)
Posso escolher algumas, marcar como Key Images e imprimir só as selecionadas
Resultado: impressão organizada e bem mais enxuta, sem desperdiçar páginas com cortes irrelevantes.6min
Intranet DICOM: servidor PACSNesta aula eu explico como montar uma rede básica (intranet) usando o OsiriX como servidor PACS/DICOM, sem acesso externo e sem depender de internet. O objetivo é ter um fluxo simples de clínica/consultório: os aparelhos de ultrassom enviam automaticamente os exames DICOM para um Mac com OsiriX (servidor) e todos os computadores da rede interna conseguem acessar (visualizar) e enviar exames para esse servidor, centralizando o armazenamento.
Conceito da rede (intranet)
O OsiriX funciona como servidor de imagens (PACS): armazena, envia e recebe exames no formato DICOM.
Fluxo típico:
Exame feito no ultrassom
Envio automático DICOM para o servidor (Mac + OsiriX)
Outros computadores na rede acessam os exames no servidor
Exames externos (ex.: tomografia recebida) também podem ser enviados para o servidor e ficar armazenados lá
Exemplo prático do consultório (do vídeo)
2 aparelhos de ultrassom com rede:
Siemens X300
SonoSite M-Turbo
Dica importante: ao comprar ultrassom, negociar o cliente DICOM (software).
Evitar “gambiarras” como captura de vídeo, que não gera DICOM.
1) Planejamento básico da rede
Entender o IP da rede local:
Exemplos citados: 192.168.0.x, 192.168.1.x (caso do vídeo) e roteador Apple com padrão 10.0.0.x.
O roteador geralmente é o .1 (ex.: 192.168.1.1).
2) Servidor (Mac) dedicado
Recomendação: Mac mini dedicado como servidor (baixo consumo, ocupa pouco espaço).
Preferir o servidor sem uso para outras funções.
Conexão de rede: cabo (Ethernet) é mais confiável e mais rápido do que Wi-Fi.
3) Configurar IP fixo no servidor (evitar DHCP)
Não usar DHCP, para evitar que o IP mude após queda de energia, reset/troca de roteador etc.
No exemplo do vídeo:
Rede: 192.168.1.x
Servidor: 192.168.1.10
Roteador: 192.168.1.1
Máscara de sub-rede conforme a rede local
4) Configurar o OsiriX como Listener (recebedor DICOM)
Em Preferências do OsiriX:
Ativar o Listener (receber imagens DICOM quando o OsiriX estiver aberto)
Definir os parâmetros:
AETitle: nome do nó na rede PACS (no vídeo: “amato”)
Porta: no vídeo é 1112 (precisa saber IP + porta)
IP: o IP fixo do próprio servidor (ex.: 192.168.1.10)
Ativar:
Compartilhamento do banco de dados do OsiriX
Publicar o nó DICOM via Bonjour
Assim, outros OsiriX na rede detectam o servidor automaticamente, sem configuração extra
Opcional:
Server Mode (quando o Mac é dedicado) para economizar recursos e manter o servidor “leve”.
5) Configurar os aparelhos de ultrassom (DICOM)
Cada fabricante tem sua tela, mas os dados essenciais são:
Alias / nome do aparelho
AETitle do aparelho
IP do servidor OsiriX
Porta (ex.: 1112)
Teste de comunicação: ping/verify (no exemplo Siemens, conectou imediatamente)
Configurações mostradas no vídeo:
Siemens: servidor OsiriX com AETitle “amato”, IP 192.168.1.10, porta 1112; uso de auto-store DICOM (gravar automaticamente, inclusive durante a execução do exame).
SonoSite: IP fixo no aparelho (ex.: 192.168.1.8, DHCP desligado), envio configurado para o servidor OsiriX; opção de envio ao final do exame (no caso portátil) e arquivamento no “archiver”.
6) Acesso remoto ao servidor (para administrar à distância)
Como o servidor fica “num canto”, o vídeo mostra habilitar no Mac:
Compartilhamento → Gerenciamento remoto (Remote Management) para acessar o servidor de outro Mac.
7) Manter o OsiriX ligado 24/7
O servidor só existe se o OsiriX estiver aberto.
Adicionar o OsiriX em Itens de Início de Sessão (Login Items)
Usar Lingon 3 para manter o OsiriX sempre rodando:
Criar um “job” para reabrir o OsiriX automaticamente se ele fechar/for encerrado
No vídeo: Lingon 3 custa US$ 5
Ativar login automático do usuário no Mac após reinício (ex.: queda de energia)
8) Como o servidor aparece nos outros computadores
No OsiriX do computador cliente, o servidor aparece automaticamente (via Bonjour).
No exemplo:
Um nó mostra os exames do servidor (acesso ao banco)
Outro nó aparece para receber envios (arrastar um exame do cliente para enviar ao servidor)25min